中共云南农业大学委员会组织部是在校党委领导下负责全校党的组织建设和干部队伍建设的职能部门。

认真贯彻执行党的组织路线和干部路线。按照上级部门有关组织工作的指示精神和校党委的决议要求，从学校实际出发，制定开展组织工作的计划及实施措施，经党委批准后贯彻落实，为完成学校的根本任务和中心工作提供组织保证。

注重抓好党的基层组织和党员队伍建设。坚持和完善组织生活制度及其它各项规章制度，努力探索新时期加强基层组织建设的新方法和新途径；负责全校党员的教育、管理工作；认真做好党员发展工作；发展党内民主，完善党代表大会制度，落实党代表任期制；开展党建研究，推动党建工作规范化、制度化和科学化建设。

认真贯彻党的干部政策，重视学校中层领导班子和干部队伍建设。会同有关部门做好中层班子的思想、组织、作风、制度和党风廉政建设。在党委领导下做好中层领导班子的调整、充实、配备和换届工作，做好中层干部的培养、考察、选拔、任用、管理、考核、监督等工作；抓好年轻干部队伍建设；推动干部轮岗交流和对外交流。

重视做好党员、干部和入党积极分子的教育培训工作。根据学校发展战略，开展领导干部、后备干部和中青年骨干培训工作，提高治校理教和推动科学发展的能力；负责入党积极分子和发展对象培训。